福建省金門縣人，出生於台灣省台北縣，自幼習樂，曾於七十五年獲台北縣音樂比賽雙簧管少年組第一名，七十六年隨秀山國小管弦樂團至美國參訪演出；八十二年隨中正高中管弦樂團至澳洲參訪演出，並於同年獲得台北縣音樂比賽雙簧管青少年組第一名，之後進入輔仁大學音樂系就讀，擔任輔仁大學管弦樂團與管樂團之雙簧管首席，並隨團參與至國家音樂廳等多次的全國巡迴演出，並於八十七年錄製白遼士『幻想交響曲』音樂專輯，並於八十五至八十七年獲台灣省音樂比賽雙簧管成人組第一名。八十三年考進幼獅管樂團，八十四年曾赴奧地利參加國際音樂營的活動，並參與演出，師事皮爾‧懷特 (Pro. Feit) 教授，九十年參加『2001年第六屆指揮研習營』。

由范金耀老師啟蒙，後曾師事蔡興國、林麗玥、劉廷宏、張美慧、仲村幸夫、雪倫柏格 (H. Schellenberger，柏林愛樂首席)、湯瑪士羅德 (Tomas Rohde，德國歌劇院雙簧管首席)、羅拉愛別克 (Laura Albeck，新英格蘭音樂院教授)等教授；並於大學畢業後獲得美國新英格蘭音樂院及百克林音樂院獎學金，後進入東海大學音樂研究所就讀，主修雙簧管演奏，師事劉榮義教授。在校期間曾參加育芝管弦樂團、古典管弦樂團、愚韻室內管弦樂團並擔任雙簧管首席，且與該樂團參與多次的演出；八十七年度參與名音樂家『馬修‧連恩』之環保音樂會演出，擔任雙簧管首席；八十八年及九十年間，曾隨幼獅管樂團赴韓國濟州參加國際音樂節及匈牙利的演出；八十七年至九十年間為風潮唱片錄製多張音樂專輯，包括『森林狂想曲』、『戀戀溫泉』、『故事』、『回憶』及『夜的精靈』等；八十九年度考進台北市立交響樂團之儲備團員以及赴美擔任新英格蘭音樂院指揮課程中之雙簧管演奏者，九十年與台北縣教師管樂團協奏演出林姆斯基高沙可夫雙簧管協奏曲，同年另與台北縣新莊市管樂團協奏演出林姆斯基高沙可夫及韋伯之雙簧管協奏曲，並多次應邀於電視台『臺灣最美麗的聲音』中獨奏並接受專訪。九十年於東海大學取得音樂演奏碩士學位。九十一年考進台北市立交響樂團附設管樂團雙簧管首席。

92~95 年發表過數場音樂會：92 年 1 月“芸遊十方”許芷芸雙簧管獨奏　會；93 年 8 月“魔法音樂世界”雅韻室內樂團音樂會；93 年 12 月”浮光掠影”許芷芸與她的朋友們；94 年 4 月“兒童音樂世界”雅韻室內樂團音樂會。並於93年間與林少英、顏志文、賴日陞、胡東龍、蔡柏松、唐厚明以及黃宏一老師等組成”跨界樂集”合作發行”心的搖籃”專輯（已入圍金曲獎）。

目前擔任台北市立交響樂團附設管樂團之雙簧管首席，雅韻室內樂團團長及中華民國管樂協會秘書；任教於南華大學音樂系、台北縣碧華國小音樂班、羅東高中音樂班、宜蘭縣國華國中音樂班及新明國中音樂班，中壢市新勢國小音樂班；擔任頭城國中及頭城國小管樂團指揮；另指導台北市新湖國小管樂團、土城樂利國小、板橋信義國小及台北市私立復興國中小學等多個音樂團體。

許芷芸老師之學生獲獎紀錄：

94 年南華大學音樂系官泰佑同學甄選上國立台灣大學音樂學研究所。
94 年南華大學音樂系蘇玨文同學甄選上國立台北師範學院音樂學研究所。
94 年羅東高中邱詩群同學以全台灣雙簧管第一名高分之成績甄選上師範大學音樂學系以及國立台北藝術大學音樂系。
94 年 羅東高中 林喬同學 參加台灣區音樂比賽雙簧管 個人組第一名。